За последние годы вокзал Уфы несколько раз был реконструирован, полностью был изменен второй этаж, более современным стал зал ожидания. На данный момент полным ходом идет реконструкция первого этажа, в связи, с чем в зале ожидания построены временные пластиковые павильоны для кассиров. Ремонт будет проходить по всему первому этажу, после которого в кассовом зале вместо боковых касс, откроется вход в новое здание с куполом.

На вокзале Уфы имеется несколько залов ожидания, ресторан, кафе и вместительное багажное отделение. Работают эскалаторы, лифты, а на электронных мониторах показывают информацию о расписании поездов. Теперь на уровне с современным вокзалом гостей города готовый встерить гостиницы у ЖД вокзала Уфы, которые оснащены на европейском уровне и не разочаруют приезжих.

Из Уфы движение поездов происходит в разные концы страны. По маршруту Уфа – Москва следуют десятки поездов, среди которых есть прямой фирменный поезд «Башкортостан», оснащенный кондиционерами, в вагонах есть холодильники и микроволновые печи.

В новом здании вокзала изменятся платформы, весь комплекс будет оборудован наружными инженерными сетями и коммуникациями, включая и очистные сооружения. Площадь железнодорожного вокзала составит 26526 м2, привокзальная площадь будет составлять 9345 м2, а общая вместимость нового вокзала будет иметь 6200 пассажиров.